再说奉系内部，杨宇霆的党羽，希望由杨氏出而组阁，冀得利益均沾。张学良察觉后，恐杨氏专权，将有尾大不掉之势，乃进言其父阻之。张作霖一度动念将杨宇霆免职。杨宇霆在组阁无望的情况下，又转而想自组一新国民党，俟势力壮大后，离张作霖而独立。但其表面则仍敷衍张氏。
张学良见乃父之总统目的未达到，自己极欲一试身手，遂向其父自告奋勇攻打河南，解决吴佩孚，以扩张奉系的势力范围。张作霖征求杨宇霆的意见，杨氏期期以为不可，相反力主联合吴佩孚。无奈张学良固执己见，张作霖终以爱子情切，姑容允之。张学良出师后，直渡黄河，长驱入豫。此次奉吴的河南战争是北洋军阀史上最后一次较具规模的混战。奉系依靠优势兵力和利用吴军内部裂隙取得了胜利，但在战争中也受到了重创。吴佩孚的直系残余自此土崩瓦解。奉系成为硕果仅存的一支军阀势力。
奉系军阀自掌控北京政局后，对“赤化”势力的镇压不遗余力。1926年4月26日，奉系军阀以“宣传赤化”罪名查封京报馆，逮捕并枪杀了该报社长邵飘萍。同年8月6日，《社会日报》主笔林白水因在文章中触犯了张宗昌等人，也被扣上“宣传赤化”的罪名而被处死。1927年3月1日，苏俄商船赴汉口装运茶叶时，在浦口被张宗昌的直鲁联军查出载有鲍罗廷之妻及苏俄外交官员数人而被扣留。