10月19日,“执委会”成员从早到晚,又开会讨论了一天一夜。经过辩论,空袭派成了少数派,封锁派开始占据上风。会议并决定由肯尼迪于22日晚上发表一个措词强硬的演说,向美国和全世界宣布苏联在古巴部署进攻性导弹的事实和美国的对策。肯尼迪原则上同意封锁古巴,但在最后拍板前,他两次召见空军指挥官,仔细询问空袭古巴是否可行。他得到的回答是:即使对古巴发动大规模空袭,也未必能消灭苏联在古巴的全部导弹发射场和核武器。即是说,空袭不能解决问题,还可能把局势弄僵。于是,肯尼迪接受了封锁古巴的建议。
此后,美国为封锁古巴开始做准备。当天下午6点,美国国家安全委员会召开会议,就封锁古巴的细节进行部署。外交上,美国务院官员开始对美洲国家组织进行拉拢工作;艾奇逊被派到欧洲,向戴高乐和北约组织通报美国即将采取的行动。宣传上,美国新闻署与各家私营电台做出专题节目转播安排,准备把肯尼迪的讲话用西班牙语对古巴和拉丁美洲播放。军事上,美三军加强戒备,海军在加勒比海部署了180艘舰艇;B—52轰炸机部队奉命满载原子武器在空中进行值班飞行;第一装甲师深夜从得克萨斯出发,开往佐治亚州的港口准备上船,美军还有另外5个师也处于戒备状态。