奥格斯堡宗教和约承认路德派与天主教在帝国内的平等地位，是欧洲第一个经统治者签署的宽容新教的和约，当然是路德派的巨大胜利。其他新教，如卡尔文教，不包括在内。和约虽然承认帕绍条约前已没收的教产为合法，但未制定具体处理办法，教产之争仍然层出不穷。其实，奥格斯堡和约的基本原则，早在1526年的施佩耶尔帝国议会、1532年的纽伦堡帝国议会已有类似的规定，然而天主教方面总是不愿认真遵守。经过几十年的较量，天主教方面终于懂得不承认路德派终究不是解决问题的办法，终于又回到原来的起点上。有人说奥格斯堡宗教和约确立了信仰自由，不过这种信仰自由是属于诸侯的，群众只能根据诸侯的信仰来确定自己的信仰。和约宣告查理五世加强皇权政策的彻底破产。就在和约签订之年，查理宣布退位，将帝国和西班牙分别交给费迪南德和其子菲利普统治，帝国实际瓦解。从此，欧洲出现两支哈布斯堡王室。
奥格斯堡宗教和约在西欧也有一定的影响。根据当时人的概念，所谓神圣罗马帝国泛指整个西欧。从此，教皇不能仅仅因为某人信奉路德派就予以驱逐出教。英国女王伊丽莎白巧妙地利用这一点，删去他的信条中可能与路德教相矛盾的地方。1570年，教皇把女王驱逐出教，罪名仅仅是因为采用卡尔文的邪恶圣餐礼。